支序图生成器
列出生物名称，或贴上性状表格，AI 会理清嵌套的支系并画出分支正确的演化树。不需要序列比对文件，也不用装桌面软件。
支序图示例
同一棵演化树的五种画法，每种都配有真实生成的图 —— 点击卡片即可套用样式，或放大查看完整图像。
什么是支序图？
支序图（cladogram）是一种分支图，表示一组生物之间由共同祖先衍生而来的亲缘关系。每个末端是一个类群，每个分支点（节点）代表其上方所有类群最近的共同祖先，而任一节点连同它的全部后代就构成一个支系（clade）。分支上通常标注在该处首次出现的衍生性状——共近裔性状。这正是支序图不只是一幅画而是一个论证的原因：共有性状的嵌套关系，就是类群嵌套关系的证据。
支序图只表达分支顺序，枝长没有任何含义。这正是它与 phylogram（枝长正比于遗传变化量）以及 chronogram（枝长代表时间）的区别。这个支序图生成器负责出图——用日常语言描述这组生物，或者贴上性状表，AI 会解出拓扑并画成可直接用于习题、讲义、学位论文或期刊论文的图。
要点
- 支序图只表示分支的先后顺序。分支的长度没有含义，画得长并不代表变化更多或时间更久。
- 支系是指某个节点连同它的全部后代；命名一个支系，指的是指向一个节点，而不是图上的某一片区域。
- 分支上标注的是共近裔性状——在该节点首次出现、并为其上方所有类群共有的衍生性状。
- 决定根落在哪里的是外类群；没有外类群，同样的分支形态就没有方向。
- 在任何节点上旋转分支，都会得到一张外观不同、但完全相同的树。
支序图是怎么生成的
描述这组生物
列出生物名称、贴上性状矩阵、给一段 Newick 字符串，或者干脆只写类群名——「人科的几种猿」。AI 会理清嵌套的支系；你没有指定拓扑时，采用目前公认的系统发育关系。
选择树形样式
每个分支点都标出性状的经典教学阶梯图、适合发表的干净直角树、树与其性状矩阵并排的组合图、末端配生物插图的版本，或者白板手绘风。
在工作台里细调
支序图会在你的工作台中打开，可以局部重绘、调整标签、超分放大，并导出高分辨率文件，用于讲义、幻灯片、海报或论文。
支序图的组成部分
各种教科书和期刊上的支序图都能读懂，是因为它们都由同一批基本元素构成。下面是阅读支序图时会遇到的术语，也是生成器可以为你标注的部分：
根
树的基部——图中所有类群的共同祖先。
节点
分支点：由此分开的各支系最近的共同祖先。
分支
两个节点之间的一条谱系，长度不表达任何含义。
末端（类群）
被比较的终端单元——一个物种、属或更大的类群。
支系
一个节点连同它的全部后代，不多也不少。
外类群
研究类群之外的类群，用来确定树的根。
共近裔性状
衍生性状，标在首次出现处，此后各支共有。
多歧分支
同一节点分出三支以上——先后顺序尚未解决。
同一棵树可以有很多种画法。支序图可以画成直角式、斜线式或阶梯式，任何节点上的分支都可以自由旋转——这些都不改变它所陈述的亲缘关系。两张看起来完全不同的图，可能是同一棵树。
怎样读支序图才不会读错
对这类图的误解，几乎都来自把画法当成了图本身的主张。三点值得单独点出来：
最右边的类群不是「最进化的」
末端的排列位置只是绘图约定，不是排名。所有现生末端从根算起经历的时间完全一样——苔藓和向日葵一样「现代」。把任何节点上的分支旋转一下，树没有变。
亲疏要顺着节点看，不是按纸面距离看
两个并排印在一起的末端可能是远亲。关键在于它们的谱系在哪里汇合：共享最近共同祖先的类群关系最近，无论它们在图上离得多远。
末端之间不存在祖先关系
支序图从不表示某个现生类群是另一个现生类群的后代。祖先位于节点上，而且这些祖先是假设性的——由性状推断出来，并不是图上画出的哪个生物。
支序图用在什么地方？
练习卷、复习笔记与实验报告
进化单元的习题、复习笔记和实验报告——从性状表建树，矩阵和图一次出在同一张图里；上课本身则可以用白板手绘版。
讲座与科普传播
带插图的版式会在每个末端配一个生物形象，正是幻灯片和科普文章需要的那种图——系统发育软件画不出来，找插画师则要另外约稿。
论文、学位论文与海报
干净的直角树，类群名和支系标签都准确，可用于背景章节、综述或海报的一栏，不必打开建树软件，也不用准备数据文件。
支序图、支长树与年代树的区别
支序图是系统发育树的一种，只表示分支顺序，别无其他。支长树（phylogram）的枝长与遗传变化量成正比；年代树（chronogram）的枝长表示时间。三者主张的亲缘关系相同，但只有支序图不对「变化了多少」和「过了多久」作出任何断言。 问一张图「是支序图还是系统发育树」，其实是在问它的枝长有没有含义。
| 支序图 | 支长树 | 年代树 | |
|---|---|---|---|
| 枝长表示 | 不表示任何东西 | 遗传变化的量 | 经过的时间 |
| 末端是否对齐 | 对齐，右端齐平 | 不对齐，变化到哪就止于哪 | 对齐，止于现在 |
| 有无时间轴 | 没有 | 没有 | 有，以年或百万年为单位 |
| 依据 | 共有的衍生性状 | 序列数据加一个模型 | 序列加化石标定 |
| 是否给出分支顺序 | 是 | 是 | 是 |
| 能否回答「差异有多大」 | 不能 | 能 | 不能 |
| 能否回答「距今多久」 | 不能 | 不能 | 能 |
支序图并不比支长树「更不准确」，它只是主张得更少。如果你的数据支持分支顺序但支持不了变化速率，画支序图才是诚实的做法。
关于支序图的常见问题
AI 支序图生成器是怎么工作的？
你用日常语言描述这组生物。AI 先理清嵌套的支系——哪些类群构成每个支系、每个节点由什么衍生性状标记——然后把树画出来，末端用你给的类群名。只给一个类群名，它就采用目前公认的系统发育关系；给它一张性状矩阵，它就建出这份数据所支持的树。
可以从性状表格建树吗？
可以，而且这是它最擅长的用法之一。把表格贴进去，选 树 + 性状矩阵 样式：衍生性状最少的类群会成为外类群，每个性状标注在它首次出现的节点上，成图会把树和它所依据的矩阵并排画出来——正是课堂练习要的那张图。
能读 Newick，或者我已经确定好的拓扑吗？
可以。贴一段 Newick 字符串，或者直接把拓扑写清楚，图会严格按你指定的画，而不会被「订正」成教科书版本。如果你要求的结构与公认的系统发育关系冲突，图仍按你的要求画，工作台里的说明会指出这一点。
这是系统发育分析软件吗？能载入序列比对或给出自展值吗？
不是——它做的是用于教学、发表、幻灯片和文章的树*图*，不做系统发育推断。如果你需要从序列数据估计树并给出支持率，请用 MEGA、RAxML、IQ-TREE 或 iTOL；如果你要的是一分钟左右拿到一张干净、看起来正确的支序图，这条路更快。
支序图和系统发育树有什么区别？
支序图也是系统发育树，但它只表达分支顺序，枝长是任意的。phylogram 的枝长正比于演化改变量，chronogram 的枝长代表时间。教学材料和大多数概念性配图用的都是支序图，因为要说的就是亲缘关系本身。
支序图生成器免费吗？生成的图能商用吗？
免费方案即可生成支序图（导出带水印）。付费方案去除水印，并解锁全部模型与高分辨率导出；你可以把这些图用于课程、出版物和商业材料。
支序图该怎么读
要看节点，而不是横着看这一页。 两个末端如果由靠近末端的节点相连，就是近亲；如果要一路下到根部才能连上，就是远亲——它们在纸面上挨得多近都不相干。末端不是从左到右排名次的，现存的末端之间也没有谁「更进化」：从根算起，每一个末端经历的时间都一样长。
什么是支系（clade）
支系是树上的某个节点连同它的全部后代，一个都不能少。 鸟类和鳄类加上它们的共同祖先构成一个支系；而通常意义上的「爬行动物」不是，因为这个说法把鸟排除在外，却又包含了鸟的祖先。漏掉部分后代的类群叫并系群，把不相关的分支拼凑在一起的叫多系群，两者都不是支系。
什么是外类群，支序图为什么需要它
外类群是已知位于所研究类群之外的一个类群，它用来判断哪些性状状态是祖先状态，从而确定根的位置。没有外类群，分支形态就没有方向：同一棵树可以在好几个位置生根，而每种生根方式对亲缘关系的说法都大不相同。
支序图上的节点代表什么
节点代表其上方所有类群最近的共同祖先。它是一个假设，不是一块化石：它代表由性状证据推断出曾经存在过的祖先种群，通常既没有名字，也没有对应的标本。
什么是共近裔性状
共近裔性状是某个支系全体成员共有的衍生性状，因为它最早出现在它们的共同祖先身上——比如鸟类的羽毛，或者把鸟类和鳄类合在一起的四腔心脏。共近裔性状是分组的证据；单纯的祖先性状，或各自独立演化出来的性状，都不是。
怎样从零开始做一张支序图
先列一张性状表：类群排成行，性状排成列，并把外类群也放进去。与其余类群共有衍生性状最少的那一类先分出去，此后每多一个衍生性状就确定下一个节点。把这张表贴进来，就会直接据此构建树形；只用文字描述类群的话，则采用目前公认的系统发育关系。
两张看起来不同的支序图会表示同样的关系吗
会，而且这是最常见的误读。 任何节点上的分支都可以自由旋转，同一棵树可以画成直角式、倾斜式或阶梯式。两张看上去毫不相像的图，完全可能是同一棵树——真正携带信息的只有节点的嵌套关系。
