계통수 생성기
생물 이름을 적거나 Newick 문자열을 붙여넣으면, AI가 분기 순서를 정리하고 가지 길이를 비율에 맞춰 그린 뒤 지지도와 축척 막대까지 넣어 줍니다. 정렬 파일도, 데스크톱 소프트웨어도 필요 없습니다.
계통수 스타일
같은 계통수를 그리는 다섯 가지 방식을 실제 생성 결과로 보여 드립니다. 카드를 클릭하면 스타일이 적용되고, 확대하면 전체 이미지를 볼 수 있습니다.
계통수란?
계통수는 종, 개체군, 유전자 같은 생물 집단이 공통 조상으로부터 어떻게 갈라져 나왔는지를 보여 주는 분기 그림입니다. 각 말단은 하나의 분류군이고, 내부 마디는 그 너머 모든 것의 가장 최근 공통 조상이며, 그 사이의 가지가 계통입니다. 일반 분지도(클라도그램)와 결정적으로 다른 점은 여기서는 가지 길이가 양을 나타낸다는 것입니다. 가지 길이 계통수(phylogram)에서는 그 계통에 쌓인 진화적 변화량에 비례하고, 연대 계통수(chronogram)에서는 흘러간 시간 자체이며, 어느 쪽을 보고 있는지는 축척 막대가 알려 줍니다.
발표되는 계통수에는 보통 두 가지가 더 붙습니다. 마디마다 표시되는 지지도 — 부트스트랩 값이나 베이즈 사후확률 — 는 그 묶음을 데이터가 얼마나 강하게 뒷받침하는지를 말해 주고, 외군은 계통수에 뿌리를 주어 계통이 뻗어 나간 방향을 정합니다. 이 계통수 생성기는 그림을 그리는 일을 맡습니다. 그룹을 평범한 말로 설명하거나, Newick 문자열을 붙여넣거나, 직접 계산한 분기 연대를 주면, AI가 위상을 확정해 강의 슬라이드에도 학위논문에도 학술지 논문에도 바로 쓸 수 있는 그림으로 만들어 줍니다.
사용 방법
그룹을 설명합니다
종 이름을 나열하거나, 가지 길이가 포함된 Newick 문자열을 붙여넣거나, 분기 연대를 주거나, 그냥 "대형 유인원"처럼 그룹 이름만 적어도 됩니다. AI가 분기 순서와 각 계통이 뻗은 길이를 정하며, 따로 지정하지 않으면 현재 통용되는 계통 관계를 사용합니다.
계통수 스타일을 고릅니다
가지 길이를 비율대로 그리고 마디마다 지지도를 붙인 논문용 계통수, 가로축이 백만 년 단위인 시간 보정 계통수, 분기군을 색으로 묶은 리뷰용 그림, 말단에 생물 그림을 넣은 버전, 화이트보드 스케치 중에서 고르세요.
워크스페이스에서 다듬습니다
생성된 계통수는 워크스페이스에서 열리며 부분 수정, 라벨 조정, 업스케일, 고해상도 내보내기가 가능합니다. 슬라이드, 포스터, 학위논문, 학술지 논문에 그대로 쓸 수 있습니다.
계통수를 이루는 요소
발표된 계통수가 담고 있는 정보는 분기 순서만이 아니며, 거기에 더해진 것일수록 그냥 지나치기 쉽습니다. 아래는 그 정보를 담고 있는 요소들로, 계통수를 읽을 때마다 확인할 만한 것이자 생성기가 그림에 대신 표기해 줄 수 있는 것들입니다.
가지 길이
계통이 가로로 뻗은 길이 — 분지도가 버리는 것이 바로 이 값입니다.
축척 막대
가지 길이 한 단위의 의미. 보통 자리당 치환 수로 나타냅니다.
지지도
마디의 부트스트랩 값이나 사후확률 — 데이터가 그 분기를 얼마나 뒷받침하는지.
마디 연대
시간 보정 계통수에서 그 마디가 가로축의 어디에 놓이는지, 백만 년 단위로.
외군
관심 그룹 밖의 분류군. 이것이 없으면 계통수는 뿌리도 방향도 갖지 못합니다.
말단 정렬 여부
말단이 한 줄로 맞춰지는지, 저마다 제 깊이에서 멈추는지 — 어떤 종류의 나무인지 알려 주는 첫 단서.
자매군
한 마디에서 갈라진 두 계통. 이 나무 위에서 서로가 서로의 가장 가까운 친척입니다.
위상
뿌리·마디·말단·분기군으로 이루어진 분기 골격. 이 부분은 어떤 분지도와도 같습니다.
정보를 담고 있는 것은 가로축뿐입니다. 말단이 세로로 놓인 순서는 작도 관습일 뿐입니다. 어느 마디에서든 두 가지는 자유롭게 회전할 수 있고, 같은 계통수를 직각형으로 그리든 사선형으로 그리든 원형으로 그리든 그것이 말하는 관계는 하나도 달라지지 않습니다.
뿌리, 마디, 말단, 분기군은 분지도를 포함해 어떤 나무에서든 같은 뜻이므로 이 페이지에서 다시 정의하지 않습니다. 그 용어는 아래 페이지에 모두 정리되어 있습니다. 분기도 생성기
계통수를 잘못 읽지 않으려면
이런 그림에서 생기는 오해는 거의 전부, 계통수가 말하지 않은 것을 그림에서 읽어 내는 데서 나옵니다. 짚어 둘 만한 세 가지입니다.
거리는 지면이 아니라 가지를 따라 잽니다
나란히 인쇄된 두 말단이 실은 먼 친척일 수 있습니다. 가까운 정도를 정하는 것은 두 계통이 어디서 만나는가 — 가장 최근 공통 조상을 공유하는 분류군이 가장 가깝습니다 — 이며, 가지 길이 계통수에서 진화적 거리는 두 말단을 잇는 가지 길이의 합이지 두 행 사이의 간격이 아닙니다.
가지가 가장 긴 쪽이 가장 '앞선' 것은 아닙니다
살아 있는 말단은 모두 뿌리로부터 정확히 같은 시간을 지나왔습니다. 가지가 길다는 것은 그 계통에 변화가 더 많이 쌓였다는 뜻이고, 대개는 진화 속도가 빠르거나 일찍 갈라졌기 때문입니다. 더 복잡하거나 더 성공했거나 더 '현대적'이라는 뜻이 아닙니다.
지지도가 없는 마디는 확정된 관계가 아닙니다
부트스트랩 값 55는 데이터가 그 묶음을 다른 대안보다 간신히 선호한다는 뜻일 뿐입니다. 지지도가 낮거나 아예 표시되지 않은 계통수는 하나의 가설을 말하고 있는 것이며, 믿고 기댈 수 있는 부분은 지지도가 높은 곳뿐입니다.
누구에게 필요한가요?
논문·학위논문·리뷰
정확한 학명, 지지도, 축척 막대를 갖춘 깔끔한 계통수를 서론의 배경 설명이나 리뷰, 분류학 도판에. 데이터 파일을 준비할 필요도, 작도 소프트웨어를 열 필요도 없습니다.
강의·과학 커뮤니케이션
시간 보정 계통수나 말단에 그림을 넣은 도판은 슬라이드와 해설 기사에 꼭 필요한 종류입니다. 계통 분석 소프트웨어로는 그릴 수 없어 지금까지는 일러스트레이터에게 의뢰해야 했던 그림입니다.
교사·학생
진화 단원 수업 자료, 정리 노트, 실험 보고서에. 그룹 이름만 적으면 뿌리·마디·분기군·외군이 제자리에 놓인 그림이 나오고, 수업용으로 화이트보드 버전을 받을 수도 있습니다.
자주 묻는 질문
AI 계통수 생성기는 어떻게 작동하나요?
평범한 말로 그룹을 설명해 주시면 됩니다. AI가 먼저 위상 — 어떤 분류군이 어떤 분기군을 이루는지, 각 계통이 얼마나 뻗는지, 각 마디에 어떤 값이 붙는지 — 을 정한 다음, 지정하신 학명을 말단에 그대로 넣어 계통수를 그립니다. 그룹 이름만 주면 현재 통용되는 계통 관계와 발표된 가지 길이를 쓰고, 직접 만든 계통수를 주면 그쪽을 따릅니다.
Newick 형식을 읽을 수 있나요?
읽을 수 있습니다. Newick 문자열을 붙여넣으면 위상이 적힌 그대로 그려지고, 가지 길이와 지지도도 그대로 옮겨집니다. 파일이 없다면 "사람과 침팬지가 먼저 묶이고, 그다음 고릴라, 마지막에 오랑우탄"처럼 말로 적어 주셔도 똑같이 됩니다.
분기 연대가 들어간 시간 보정 계통수도 만들 수 있나요?
만들 수 있습니다. 시간 보정 계통수 스타일을 고르세요. 각 마디의 연대를 직접 주셔도 되고, 그룹 이름만 적으면 AI가 발표된 분기 연대 추정치를 사용합니다. 그림에는 백만 년 단위의 가로축이 들어가고 마디 연대가 축 위에 표시되며, 모든 말단이 현재까지 이어집니다.
이것도 계통 분석 소프트웨어인가요? 정렬 파일을 올리거나 부트스트랩 값을 계산할 수 있나요?
아닙니다. 논문·수업·슬라이드·기사에 쓰는 계통수 *그림*을 만드는 도구이지 계통 추정을 하지는 않습니다. 서열 데이터로 계통수를 추정하려면 MEGA, RAxML, IQ-TREE, MrBayes, iTOL을 쓰세요. 지정해 주신 지지도는 그대로 그려지지만, 지정하지 않은 값은 그럴듯한 발표 수치일 뿐 여러분의 데이터를 계산한 결과가 아닙니다.
계통수와 분지도(클라도그램)는 무엇이 다른가요?
분지도는 분기 순서만 보여 주고 가지 길이에는 의미가 없습니다. 가지 길이 계통수는 가지 길이를 진화적 변화량에, 연대 계통수는 시간에 대응시킵니다. 셋 다 계통수에 속하니 전하려는 내용에 맞춰 고르세요. 관계만 중요하다면 분지도 생성기가 더 단순한 그림을 그려 줍니다.
계통수 생성기는 무료인가요? 만든 그림을 상업적으로 써도 되나요?
무료 플랜에서도 생성할 수 있습니다(내보내기에 워터마크가 들어갑니다). 유료 플랜은 워터마크를 없애고 모든 모델과 고해상도 내보내기를 열어 주며, 만든 그림은 강의, 출판물, 상업 자료에 쓸 수 있습니다.
