TGF-β訊息傳遞

TGF-β訊息傳遞路徑示意圖產生器

描述你需要的圖,就能得到帶標註的TGF-β訊息傳遞路徑:從潛伏複合體中釋出的活性TGF-beta、磷酸化ALK5的II型受體、在細胞核內與SMAD4結合的SMAD2/3,以及SMAD7的負回饋。

TGF-β訊息傳遞路徑示意圖範例

以下是四則TGF-β路徑提示詞的實際生成圖:含SMAD7負回饋的全標註路徑、六個標註的簡明概覽、纖維化路徑和空白學習單。點選即可載入提示詞並修改。

全標註路徑圖
簡明概覽
SMAD7負回饋與纖維化
空白學習單
帶標註的TGF-β訊息傳遞路徑示意圖:潛伏型TGF-β、TGFBR2、ALK5、SARA、SMAD2/3、SMAD4、標的基因、SMAD7、SMURF2
經典TGF-β/SMAD路徑,從潛伏型複合體到標的基因,並含SMAD7對ALK5的負回饋,即工具預設畫出的樣子。

兩個激酶、一組SMAD,外加一道煞車

從上往下讀,再沿右側往上看負回饋。

  1. 1

    潛伏型 → 活性TGF-β

    活性TGF-β在細胞外從LAP、LTBP中釋放出來。

  2. 2

    TGFBR2 → ALK5

    TGF-β結合TGFBR2,後者磷酸化I型受體ALK5。

  3. 3

    SARA、SMAD2/3、SMAD4

    ALK5磷酸化SMAD2/3,後者與SMAD4結合並入核。

  4. 4

    標的基因與SMAD7

    PAI-1、p15、p21、膠原蛋白啟動,SMAD7阻斷ALK5。

TGF-β訊息傳遞路徑示意圖(纖維化):TGF-β1、TGFBR2、ALK5、SMAD3、SMAD4、第一型膠原蛋白、纖網蛋白、PAI-1、SMAD7
纖維化中的TGF-β1訊息:SMAD3與SMAD4啟動第一型膠原蛋白、纖網蛋白與PAI-1,SMAD7與SMURF2反過來阻斷ALK5。

TGF-β1推動纖維化,SMAD7踩下煞車

沿中間往下讀,再沿右側SMAD7支路往上。

  1. 1

    TGFBR2 → ALK5 → SMAD3

    經兩個受體傳遞後,SMAD3與SMAD4進入細胞核。

  2. 2

    基因 → 肌纖維母細胞

    第一型膠原蛋白、纖網蛋白、PAI-1啟動,膠原纖維堆積。

  3. 3

    SMAD7負回饋

    SMAD7基因也被誘導,SMAD7與SMURF2阻斷ALK5。

什麼是TGF-β訊息傳遞路徑?

TGF-β訊息傳遞路徑把轉化生長因子β的訊息從細胞表面傳到細胞核:TGF-β結合II型受體(TGFBR2),TGFBR2磷酸化I型受體ALK5(TGFBR1),ALK5再磷酸化SMAD2與SMAD3,它們與SMAD4結合後進入細胞核,調控標的基因。標的基因之一SMAD7又會回過頭抑制受體。

重點

  • TGF-β以潛伏形式合成。弗林蛋白酶切開前驅物,但潛伏相關胜肽(LAP)仍包覆著成熟二聚體,LTBP再把它錨定在細胞外基質中;αvβ6、αvβ8等整合素、蛋白酶、血小板反應蛋白-1與酸性環境可釋出活性細胞激素。
  • 兩種受體都是絲胺酸/蘇胺酸激酶。TGF-β先結合TGFBR2;TGFBR2招募TGFBR1(ALK5)並磷酸化其富含甘胺酸與絲胺酸的GS區段,活性複合體含兩個II型受體與兩個I型受體。
  • SMAD2與SMAD3是R-SMAD,SMAD4是唯一的Co-SMAD。轉接蛋白SARA把SMAD2/3遞給ALK5,ALK5磷酸化其C端的兩個絲胺酸;磷酸化的R-SMAD隨後與SMAD4形成複合體進入細胞核。
  • 這條路徑會自我關閉。SMAD2/3–SMAD4複合體誘導SMAD7表現,SMAD7與SMAD2/3競爭結合ALK5,並把泛素連接酶SMURF1、SMURF2與NEDD4L帶到受體上,使受體被分解。
  • 同一訊息抑制早期腫瘤、卻促進晚期腫瘤。在正常細胞與癌前細胞中,TGF-β誘導p15與p21、抑制MYC,使細胞週期停滯;在晚期癌中,它推動上皮-間質轉化、侵襲與轉移。

TGF-β訊息傳遞路徑示意圖產生器怎麼用?

1

描述示意圖

說明用途和詳細程度:完整的SMAD路徑、簡明概覽,或纖維化中的SMAD7負回饋。一句話就夠。

2

選擇風格

預設是乾淨的扁平教科書畫風,白底、直箭頭、直引線標註。也可以換成水彩、墨線、3D 等其他風格。

3

調整並匯出

結果會進入你的工作區,可以局部重繪、在畫布上直接修改標註文字、放大並匯出高解析度圖檔。

TGF-β訊息傳遞路徑的組成與功能

帶標註的TGF-β路徑圖通常要畫出的分子,依訊息經過的先後排列。除非你要求更精簡的標註,這就是預設的標註組。

組成功能畫在哪裡
潛伏型TGF-β複合體(LAP、LTBP)讓成熟TGF-β保持無活性,並儲存在細胞外基質中頂部,細胞外
活化因子(整合素αvβ6、αvβ8,蛋白酶)把活性TGF-β二聚體從LAP中釋放出來潛伏複合體旁邊
TGF-β二聚體活性配體:TGF-β1、TGF-β2或TGF-β3細胞膜上方,與受體結合
II型受體(TGFBR2)先與TGF-β結合並磷酸化I型受體的激酶貫穿細胞膜
I型受體(ALK5,TGFBR1)GS區段被磷酸化後活化的激酶,磷酸化SMAD2與SMAD3在TGFBR2旁貫穿細胞膜,標一個圓圈P
SARA把SMAD2/3遞給ALK5的轉接蛋白緊貼膜下、ALK5旁邊(嚴格來說在早期內體上)
SMAD2與SMAD3(R-SMAD)被ALK5於C端兩個絲胺酸上磷酸化後脫離細胞質中,各標一個圓圈P
SMAD4(Co-SMAD)共同搭檔,形成SMAD2/3–SMAD4複合體細胞質中,正與R-SMAD結合
搭檔轉錄因子SP1、FOXO等DNA結合搭檔與p300等共活化因子,決定調控哪些基因細胞核內的DNA上
標的基因PAI-1(SERPINE1)、p15(CDKN2B)、p21(CDKN1A)、膠原蛋白(COL1A2)、JUNB與SMAD7被啟動,MYC被關閉細胞核內,圖的最底部
SMAD7與SMURF1/2抑制性SMAD,阻斷ALK5並使其分解從細胞核回到ALK5的平頭線

要畫多詳細,取決於課程層次。入門畫TGF-β、兩種受體、SMAD2/3、SMAD4與標的基因;細胞生物學課程加上SARA、SMAD7與SMURF;進階課程再加潛伏複合體與非SMAD分支(TAK1到p38與JNK,PI3K到AKT)。許多教科書把SMAD磷酸化畫在細胞膜處,而Reactome把它放在受體內吞後的早期內體上。

TGF-β訊息傳遞與BMP訊息傳遞有什麼不同?

TGF-β路徑與BMP路徑使用同一套機制(II型受體磷酸化I型受體,再由R-SMAD與SMAD4傳遞訊息),但TGF-β經由ALK5與SMAD2/3,BMP則經由ALK2、ALK3或ALK6與SMAD1/5/8。兩者都屬於TGF-β家族,人類共有33個成員。

TGF-β分支BMP分支
配體TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3(活化素與Nodal也用同樣的SMAD)BMP2、BMP4、BMP6、BMP7、GDF5等
II型受體TGFBR2BMPR2、ACVR2A、ACVR2B
I型受體ALK5(TGFBR1)ALK3(BMPR1A)、ALK6(BMPR1B)、ALK2(ACVR1);BMP9與BMP10用ALK1
結合順序先結合II型受體可單獨結合I型受體;兩型受體同時存在時結合強得多
R-SMADSMAD2、SMAD3SMAD1、SMAD5、SMAD8
Co-SMADSMAD4SMAD4
錨定蛋白SARAEndofin
DNA序列主要是SMAD結合序列(CAGAC)SMAD結合序列之外還有富含GC的序列
胞外調控LAP讓TGF-β保持潛伏Noggin與Gremlin 1捕捉BMP
典型功能抑制生長、細胞外基質、免疫調節、纖維化骨與軟骨形成;心臟、腎臟與血管發育

畫圖時讓兩個分支在受體以下只共用SMAD4。常見錯誤是把SMAD1/5/8畫在ALK5下面,或把SMAD2/3畫在BMP受體下面。高濃度TGF-β在血管內皮細胞中也能動用ALK1,但這是例外,不是教科書的標準畫法。

TGF-β訊息傳遞路徑圖用在哪裡?

TGF-β路徑圖用於細胞生物學與病理學教學,以及纖維化、腫瘤與免疫研究的示意圖。入門只需受體與SMAD;研究配圖通常還要加上潛伏複合體、負回饋環或藥物標靶。

細胞生物學課程

把受體絲胺酸/蘇胺酸激酶與受體酪胺酸激酶放在一起講:配體、II型與I型受體、SMAD與細胞核,SMAD7負回饋環是負回饋的典型例子。

纖維化研究

呈現纖維母細胞在TGF-β作用下變成肌纖維母細胞,產生膠原蛋白、纖網蛋白、PAI-1並表現α-平滑肌肌動蛋白,涵蓋肺、腎、肝與皮膚纖維化。

腫瘤生物學

呈現從抑癌到促癌的轉變:早期是p15、p21與MYC抑制,晚期是上皮-間質轉化、侵襲與轉移,也可畫上ALK5激酶抑制劑galunisertib等藥物。

研究配圖與計畫申請

在路徑上直接標出突變或藥物的作用位置:TGFBR2或SMAD4缺失、ALK5抑制劑、整合素阻斷。

關於TGF-β訊息傳遞路徑的常見問題

帶標註的TGF-β訊息傳遞路徑圖應該包含哪些內容?

標準內容包括TGF-β、II型受體(TGFBR2)、被磷酸化的I型受體ALK5(TGFBR1)、標有圓圈P的SMAD2與SMAD3、SMAD4、進入細胞核的SMAD複合體、標的基因,以及回到受體的SMAD7。更完整的圖還會加上潛伏複合體(LAP、LTBP)、SARA與SMURF泛素連接酶。

TGF-β/SMAD路徑分成哪幾步?

分六步:活性TGF-β從潛伏複合體中釋出;它結合TGFBR2;TGFBR2招募並磷酸化ALK5;ALK5磷酸化SMAD2與SMAD3;磷酸化的SMAD2/3與SMAD4結合;複合體進入細胞核,與搭檔轉錄因子一起調控標的基因。隨後產生的SMAD7再把受體壓下來。

TGF-beta和TGF-β是同一個東西嗎?

是的。TGF-beta、TGF-β與TGF-b都是轉化生長因子β的寫法。這個名稱涵蓋人類的三種亞型TGF-β1、TGF-β2與TGF-β3;Reactome等路徑資料庫畫的是TGF-β1。

SMAD7有什麼作用?

SMAD7是關閉TGF-β訊息的抑制性SMAD:它結合活化的ALK5受體,阻止SMAD2/3停靠,並招募SMURF1、SMURF2或NEDD4L替受體加上泛素,使其分解。它還會帶來磷酸酶PP1,移除ALK5上的磷酸根。由於SMAD2/3–SMAD4會啟動SMAD7基因,這是一條負回饋環。

TGF-β的標的基因有哪些?

所有細胞類型共有的標的基因很少,負回饋調節因子SMAD7與SKIL(SnoN)是主要的例外。常見、因細胞而異的標的基因包括PAI-1(SERPINE1)、CDK抑制因子p15(CDKN2B)與p21(CDKN1A)、第一型膠原蛋白(COL1A2)、JUNB與SNAIL,而MYC被抑制。

為什麼TGF-β既能抑癌又能促癌?

因為作用取決於細胞狀態:在正常細胞與早期腫瘤中,TGF-β誘導p15與p21、抑制MYC,使細胞週期停滯;但失去這條抑制增殖分支的晚期癌,會把剩下的訊息用於上皮-間質轉化、侵襲與轉移。CDKN2B缺失或FOXO等SMAD搭檔減弱,都是腫瘤完成這一轉變的途徑。

TGF-β如何引起纖維化?

TGF-β訊息過強時,纖維母細胞轉變為肌纖維母細胞,產生膠原蛋白、纖網蛋白與PAI-1並表現α-平滑肌肌動蛋白,細胞外基質隨之堆積。在小鼠中,剔除SMAD3或提高SMAD7都能預防實驗性肺纖維化。

什麼是非典型(非SMAD)TGF-β訊息傳遞?

非典型訊息傳遞是同一組受體啟動、不依賴SMAD的分支:TRAF蛋白活化TAK1,進而通往p38與JNK,另外還有活化ERK、PI3K–AKT、RHO GTP酶與NF-κB的途徑。大多數圖把它們畫成從受體伸出的一條側支。

和一般的AI繪圖工具有什麼不同?

內建了學科層面的要求。每張圖都被要求把路徑由上到下排列(配體、膜受體、SMAD、細胞核),活化用箭頭、抑制用平頭線、磷酸化用圓圈P表示,每個標註依教科書寫法拼寫正確。列印前請對照你的課本核對術語,在畫布上可以就地修改任何標註。

產生的圖可以用於教學或發表嗎?

可以,產生的圖歸你所有,可用於學習單、簡報、講義、學位論文與期刊論文。視模型不同,最高可匯出 4K 高解析度點陣圖。

產生後還能修改標註嗎?

可以。結果會在畫布工作區開啟,圖上的標註是可辨識的,改字、翻譯、移動指示線、局部重畫或換色都不需要重新產生整張圖。

繪製你的TGF-β訊息傳遞路徑圖

從一句描述到一張可列印的帶標註路徑圖,大約一分鐘。

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