Créateur de cladogramme
Nommez les organismes ou collez un tableau de caractères : l'IA dégage les clades emboîtés et trace un arbre correctement ramifié. Sans fichier d'alignement ni logiciel à installer.
Styles de cladogramme
Cinq façons de dessiner le même arbre, chacune illustrée par un rendu réel — cliquez sur une carte pour appliquer le style, ou zoomez pour voir l'image entière.
Qu'est-ce qu'un cladogramme ?
Un cladogramme est un diagramme ramifié qui représente les liens de descendance entre organismes. Chaque extrémité est un taxon, chaque point de branchement (nœud) est l'ancêtre commun le plus récent de tout ce qui se trouve au-dessus, et tout nœud accompagné de l'ensemble de ses descendants forme un clade. Les branches portent en général les caractères dérivés qui y apparaissent pour la première fois — les synapomorphies. C'est ce qui fait de l'arbre un argument et non une simple image : l'emboîtement des caractères partagés constitue la preuve de l'emboîtement des groupes.
Un cladogramme n'indique que l'ordre de branchement ; la longueur de ses branches ne signifie rien. C'est ce qui le distingue du phylogramme, où la longueur est proportionnelle au changement génétique, et du chronogramme, où elle représente le temps. Ce créateur de cladogramme se charge de la figure : décrivez le groupe en langage courant ou collez le tableau de caractères, l'IA résout la topologie et la dessine, prête pour une fiche d'exercice, une diapositive de cours, une thèse ou un article.
Comment ça marche
Décrivez le groupe
Énumérez les organismes, collez une matrice de caractères, donnez une chaîne Newick, ou nommez simplement le groupe — « les grands singes ». L'IA dégage les clades emboîtés et, à défaut de topologie imposée, s'appuie sur la phylogénie aujourd'hui admise.
Choisissez un style d'arbre
L'échelle pédagogique classique avec un caractère à chaque point de branchement, un arbre rectangulaire net pour la publication, l'arbre accompagné de la matrice dont il est issu, des extrémités illustrées, ou un croquis au tableau blanc.
Peaufinez dans l'espace de travail
Le cladogramme s'ouvre dans votre espace de travail : retouche par zones, ajustement des étiquettes, agrandissement et export haute résolution pour polycopiés, diapositives, posters ou articles.
Les éléments d'un cladogramme
Les cladogrammes se lisent d'un manuel à une revue parce qu'ils sont tous bâtis avec la même poignée d'éléments. Voici les termes que vous rencontrerez à la lecture — et ceux que le générateur peut étiqueter pour vous :
Racine
La base de l'arbre — l'ancêtre commun de tout ce qui est montré.
Nœud
Point de branchement : dernier ancêtre commun des lignées qui en partent.
Branche
Une lignée entre deux nœuds. Sa longueur ne signifie rien.
Extrémité (taxon)
Un groupe terminal — espèce, genre ou ensemble plus large comparé.
Clade
Un nœud avec tous ses descendants, et rien d'autre.
Groupe externe
Le taxon extérieur au groupe étudié ; il enracine l'arbre.
Synapomorphie
Caractère dérivé marqué là où il apparaît, partagé ensuite.
Polytomie
Trois lignées ou plus d'un même nœud — l'ordre reste non résolu.
Un même arbre se dessine de bien des façons. Un cladogramme peut être rectangulaire, oblique ou disposé en échelle, et les branches de n'importe quel nœud peuvent pivoter librement : rien de tout cela ne change les relations qu'il énonce. Deux figures qui ne se ressemblent en rien peuvent être le même arbre.
Lire un cladogramme sans le mal lire
Presque toutes les erreurs sur ces figures viennent de ce qu'on prête au dessin ce que l'arbre ne dit pas. Trois points méritent d'être nommés :
Le taxon de droite n'est pas le plus évolué
La position parmi les extrémités est une convention de dessin, pas un classement. Toutes les extrémités actuelles ont derrière elles exactement le même temps depuis la racine — une mousse est aussi moderne qu'un tournesol. Faites pivoter les branches d'un nœud : l'arbre est inchangé.
La proximité se mesure par les nœuds, pas sur la page
Deux extrémités imprimées côte à côte peuvent être des parentes éloignées. Ce qui compte, c'est l'endroit où leurs lignées se rejoignent : les taxons les plus proches sont ceux qui partagent l'ancêtre commun le plus récent, si éloignés soient-ils sur la figure.
Une extrémité n'est pas l'ancêtre d'une autre
Un cladogramme ne dit jamais qu'un groupe actuel descend d'un autre. Les ancêtres siègent aux nœuds, et ils sont hypothétiques — inférés à partir des caractères, et non l'un des organismes dessinés aux extrémités.
À qui cela s'adresse-t-il ?
Enseignants et étudiants
Fiches d'exercices, fiches de révision et comptes rendus de TP sur l'évolution : construisez l'arbre à partir d'un tableau de caractères et obtenez la matrice et le schéma dans une seule figure ; pour le cours lui-même, la version tableau blanc.
Conférences et médiation scientifique
Le style illustré place un organisme à chaque extrémité, exactement ce qu'exige une diapositive ou un article de vulgarisation — le type de figure qu'un logiciel de phylogénie ne trace pas et pour lequel il fallait commander une illustration.
Articles, thèses et posters
Des arbres rectangulaires nets, avec des noms de taxons et des étiquettes de clades exacts, pour une section d'introduction, une revue ou un panneau de poster — sans ouvrir de logiciel d'arbres ni préparer de fichier de données.
Questions fréquentes
Comment fonctionne le générateur de cladogramme par IA ?
Vous décrivez le groupe en langage courant. L'IA dégage d'abord les clades emboîtés — quels taxons forment chaque groupe, et quel caractère dérivé marque chaque nœud — puis trace l'arbre avec exactement vos noms de taxons aux extrémités. Donnez-lui seulement un nom de groupe et elle s'appuie sur la phylogénie admise ; donnez-lui une matrice de caractères et elle construit l'arbre que ces données impliquent.
Puis-je construire un cladogramme à partir d'un tableau de caractères ?
Oui, et c'est l'un de ses points forts. Collez le tableau et choisissez le style Arbre + matrice de caractères : le taxon comptant le moins de caractères dérivés devient le groupe externe, chaque caractère étiquette le nœud où il apparaît, et la figure finale montre l'arbre à côté de la matrice dont il est issu — exactement la figure demandée par un exercice de classe.
Comprend-il le format Newick, ou une topologie que j'ai déjà établie ?
Oui. Collez une chaîne Newick ou décrivez simplement la topologie : l'arbre est dessiné tel que spécifié, sans être « corrigé » vers la version des manuels. Si votre demande contredit la phylogénie admise, la figure suit votre instruction et la note dans votre espace de travail vous le signale.
Est-ce un logiciel de phylogénie ? Puis-je charger un alignement ou obtenir des valeurs de bootstrap ?
Non — cet outil produit des *figures* d'arbres pour l'enseignement, les publications, les diapositives et les articles, pas d'inférence phylogénétique. Pour estimer un arbre à partir de données de séquences avec des valeurs de soutien, utilisez MEGA, RAxML, IQ-TREE ou iTOL ; pour obtenir en une minute un cladogramme net et d'apparence correcte, cette voie est plus rapide.
Quelle différence entre un cladogramme et un arbre phylogénétique ?
Tout cladogramme est un arbre phylogénétique, mais il ne montre que l'ordre de branchement : la longueur de ses branches est arbitraire. Un phylogramme met la longueur à l'échelle du changement évolutif, un chronogramme à celle du temps. Le matériel pédagogique et la plupart des figures conceptuelles emploient des cladogrammes, parce que ce sont les relations qui comptent.
Le créateur de cladogramme est-il gratuit ? Puis-je utiliser les figures commercialement ?
L'offre gratuite permet de générer des cladogrammes (filigrane sur les exports). Les offres payantes retirent le filigrane et débloquent tous les modèles ainsi que l'export haute résolution ; vous pouvez utiliser vos figures dans des cours, des publications et des supports commerciaux.
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