Créer une carte de chaleur (heatmap) en ligne
Collez un tableau ou déposez un fichier Excel ou CSV — chaque cellule est placée par le code dans une classe de couleur exacte, et l’IA dessine une heatmap prête à publier avec étiquettes de lignes et de colonnes, valeurs et barre de couleurs.
Ou partir d'un exemple
Palettes de heatmap
Un vrai rendu par palette, chacun issu d’un jeu de données différent — cliquez sur une carte pour appliquer la palette ou reprendre ses données dans l’éditeur.
Qu’est-ce qu’une carte de chaleur (heatmap) ?
Une carte de chaleur représente un tableau de nombres par une grille de cellules colorées, une ligne et une colonne par étiquette. La couleur code chaque valeur, si bien que les motifs entre lignes et colonnes — gradients, blocs, valeurs extrêmes — se lisent d’un coup d’œil.
À propos de cet outil
- Collez un tableau copié depuis Excel, tapez-le sous la forme Colonnes : … puis une ligne Nom : valeurs par rangée, ou joignez un fichier CSV, TSV ou Excel.
- Les noms de lignes viennent de la première colonne et ceux des colonnes de la ligne d’en-tête ; les cellules vides ou NA sont dessinées comme manquantes.
- Chaque valeur est placée par le code dans l’une de cinq classes de couleur aux bornes arrondies, et les couleurs sont écrites cellule par cellule dans l’invite.
- Des données qui passent par zéro reçoivent automatiquement une échelle divergente centrée sur 0 ; « scores z » centre-réduit chaque ligne avant le classement.
- Les grilles jusqu’à 12 × 12 sont acceptées ; au-delà, les modèles d’image se trompent dans le compte des cellules, et l’outil demande de réduire plutôt que de deviner.
Calcul des scores z par ligne
Un score z par ligne indique de combien d’écarts-types une cellule se situe au-dessus ou en dessous de la moyenne de sa propre ligne. Les heatmaps d’expression génique l’utilisent pour comparer chaque gène sur la même échelle, quel que soit son niveau absolu.
z = (x − moyenne de la ligne) / écart-type de la ligne
En clair
On retire à chaque valeur la moyenne de sa ligne, puis on divise par l’écart-type de la ligne (dénominateur n − 1). Un score z de 2 signifie deux écarts-types au-dessus de la moyenne de la ligne ; le résultat est centré sur 0 et affiché sur une échelle divergente.
Le centrage-réduction est désactivé par défaut : les valeurs sont dessinées telles quelles. Écrivez « scores z par ligne » dans la description pour l’activer.
Comment faire une carte de chaleur ?
Ajoutez votre tableau
Collez des cellules depuis Excel, tapez Colonnes : S1, S2… puis TP53 : 0.95, 0.10… pour chaque ligne, ou joignez un fichier CSV ou Excel. La grille classée s’affiche au-dessus de la zone de saisie dans les couleurs exactes de la figure.
Choisissez la palette
Bleus pour des grandeurs simples, viridis pour une figure lisible par les daltoniens, bleu–blanc–rouge pour des valeurs de part et d’autre de zéro, niveaux de gris pour l’impression noir et blanc. Écrivez « sans valeurs » pour laisser les cellules vides.
Générez et affinez
L’IA peint chaque cellule d’après les classes calculées, sans jamais estimer une couleur. Continuez dans le chat — renommer, ajouter un titre, changer de palette — puis exportez en PNG, SVG ou PPTX.
Choisir une palette
La bonne palette dépend de ce que signifient les nombres, pas des goûts.
| Palette | Type | Pour | Pourquoi |
|---|---|---|---|
| Bleus | Séquentielle | Effectifs, concentrations, expression du faible au fort | La couleur fonce avec la valeur : plus foncé veut toujours dire plus |
| Viridis | Séquentielle, perceptuellement uniforme | Figures qui doivent rester lisibles pour les daltoniens et en niveaux de gris | Des écarts égaux dans les données paraissent égaux en couleur |
| Bleu–blanc–rouge | Divergente | Scores z, log fold change, corrélations de −1 à 1 | Le blanc marque zéro, les deux teintes le sens |
| Niveaux de gris | Séquentielle | Impression noir et blanc et photocopies | Lisible sans aucune couleur |
| Arc-en-ciel (jet) | À éviter | — | Sa luminosité irrégulière crée des frontières absentes des données |
| Rouge–vert | À éviter | — | Illisible pour les formes les plus courantes de daltonisme |
Environ 8 % des hommes et 0,5 % des femmes dans le monde présentent un trouble de la vision des couleurs — une palette rouge–vert ou arc-en-ciel prive donc la figure d’une partie de ses lecteurs.
Heatmap, heatmap avec clustering ou tableau ?
Une heatmap garde l’ordre de vos lignes et colonnes, une heatmap avec clustering les réordonne par similarité et ajoute des dendrogrammes, un tableau donne les nombres exacts sans le motif.
| Question | Heatmap | Heatmap avec clustering | Tableau |
|---|---|---|---|
| Ordre des lignes et colonnes | Tel que fourni — temps, dose ou ordre choisi | Réordonné par classification hiérarchique | Tel que fourni |
| Motifs visibles d’un coup d’œil | Oui | Oui, regroupés par similarité | Non |
| Valeurs exactes | Dans les cellules quand la place le permet | Rarement — trop de cellules | Toujours |
| Taille typique | Quelques lignes et colonnes, jusqu’à une douzaine | Des dizaines à des milliers de lignes | Toute taille, mais difficile à parcourir |
| Réalisée avec | Ce générateur | Un logiciel de clustering comme R pheatmap ou seaborn clustermap | Un tableur |
Ce générateur dessine des heatmaps ordonnées et ne calcule aucun clustering. Si votre analyse a classé les lignes, collez-les dans cet ordre et ajoutez le dendrogramme depuis le logiciel d’analyse, où la hauteur de ses branches est réelle.
Où utilise-t-on les cartes de chaleur ?
On utilise une heatmap dès qu’une matrice de valeurs cache un motif utile — entre gènes, échantillons, doses ou temps.
Expression génique
Gènes en lignes, échantillons ou conditions en colonnes, souvent en scores z par ligne sur une échelle divergente — le panneau de synthèse classique d’une expérience de RNA-seq ou de qPCR.
Matrices de corrélation
Coefficients de Pearson ou de Spearman deux à deux, de −1 à 1, sur une échelle bleu–blanc–rouge avec 1 sur la diagonale, pour voir quelles variables évoluent ensemble.
Grilles dose-réponse
Viabilité ou synergie selon les concentrations de deux molécules, où le gradient à travers la grille constitue le résultat.
Évaluation de classifieurs
Matrices de confusion avec les classes réelles en lignes, les classes prédites en colonnes et l’effectif dans chaque cellule.
Questions sur la carte de chaleur
Comment faire une heatmap à partir de mes données ?
Collez le tableau dans la description ou joignez un fichier CSV ou Excel, choisissez une palette et générez. Mettez les noms de lignes en première colonne et ceux des colonnes en première ligne. La grille classée s’affiche au-dessus de la zone de saisie avant qu’un crédit ne soit dépensé.
Peut-on faire une heatmap à partir d’Excel ?
Oui — joignez un fichier .xlsx, ou copiez les cellules dans Excel et collez-les directement dans la description. La feuille qui contient le plus de nombres est utilisée ; les cellules vides ou NA sont dessinées comme manquantes, pas comme zéro.
Comment faire une heatmap d’expression génique ?
Gènes en lignes, échantillons en colonnes, puis choisissez une palette — ou écrivez « scores z par ligne » pour centrer-réduire chaque gène sur sa propre moyenne et son écart-type. Les données centrées-réduites s’affichent sur une échelle bleu–blanc–rouge autour de zéro, la convention habituelle des panneaux d’expression.
Comment faire une heatmap de corrélation ?
Collez la matrice de corrélation avec les mêmes étiquettes en lignes et en colonnes. Des valeurs de part et d’autre de zéro reçoivent automatiquement une échelle divergente de −1 à 1, chaque coefficient étant inscrit dans sa cellule. L’outil trace des coefficients déjà calculés ; il ne les calcule pas à partir des données brutes.
Quelle palette choisir pour une heatmap ?
Une palette séquentielle (bleus, viridis) pour des valeurs du faible au fort, une divergente (bleu–blanc–rouge) pour des valeurs de part et d’autre d’un zéro significatif, des niveaux de gris pour le noir et blanc. Évitez l’arc-en-ciel et le rouge–vert : ils déforment les données et excluent les lecteurs daltoniens.
Quelle taille peut avoir la heatmap ?
Jusqu’à 12 lignes et 12 colonnes. Au-delà, les modèles d’image se trompent dans le compte des cellules ; l’outil refuse donc un tableau plus grand plutôt que de dessiner une grille fausse — réduisez-le, agrégez-le ou répartissez la figure en panneaux.
Peut-on masquer les nombres dans les cellules ?
Oui — écrivez « sans valeurs » ou « sans chiffres » dans la description. Par défaut les valeurs sont inscrites, en blanc sur les couleurs foncées et en noir sur les claires.
La heatmap inclut-elle un clustering ou un dendrogramme ?
Non — lignes et colonnes gardent l’ordre donné, et aucun clustering n’est calculé. Si votre analyse les a classées, collez les lignes dans cet ordre et ajoutez le dendrogramme depuis votre logiciel d’analyse.
Pourquoi des couleurs par paliers plutôt qu’un dégradé continu ?
Parce que cinq classes fixes se dessinent exactement — chaque cellule reçoit sa classe et son code couleur hexadécimal —, alors qu’un dégradé continu laisserait l’IA deviner chaque nuance. Les bornes des classes sont des nombres ronds portés sur la barre de couleurs, si bien que la plage de chaque cellule reste lisible.
L’IA modifie-t-elle ou invente-t-elle mes chiffres ?
Non. Classes, couleurs et valeurs inscrites sont calculées par du code à partir de votre tableau et écrites cellule par cellule dans l’invite. Chaque nouvelle génération les recalcule : changer de palette ne fait passer aucune valeur dans la mauvaise classe.
Carte de chaleur, heatmap, carte thermique : est-ce la même chose ?
Oui — ce sont trois noms du même graphique. Les logiciels d’analyse et la plupart des articles gardent l’anglais « heatmap » ; « carte thermique » désigne plutôt une image infrarouge.
Ce générateur de heatmaps est-il gratuit ?
Oui pour commencer — chaque nouveau compte reçoit 100 crédits gratuits, sans carte bancaire. L’aperçu de la grille classée ne coûte rien ; les crédits ne sont dépensés qu’à la génération de la figure.
Sources
- Heat maps (Points of View) — Nature Methods
- The misuse of colour in science communication — Nature Communications
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