Scientific Figure
Graphique linéaire

Créer un graphique linéaire (graphique en courbes) en ligne

Des graphiques linéaires pour les cinétiques, les courbes de croissance et les relations dose-réponse, chaque point, chaque barre d’erreur et chaque graduation étant calculés à partir de vos valeurs avant que la figure soit dessinée. Pour les comptes rendus de TP, les mémoires, les thèses et les figures d’articles.

Styles de graphique linéaire

Cinq préréglages de revue, chacun sur sa propre étude : Per2 et Bmal1 oscillant en opposition de phase sur une journée, la croissance de l’hypocotyle de Col-0 et phyB-9 en lumière rouge, le volume tumoral MC38 sous trois traitements, la variation de l’HbA1c par rapport à l’inclusion sur 52 semaines et l’optimum de température d’une amylase. Prenez une carte pour charger ses données.

Nature
Science
Cell Press
Clinique, niveaux de gris
Diapositive sombre

Exemples de graphiques linéaires

Quatre exemples de graphiques linéaires, tracés par cet outil à partir du prompt et des valeurs imprimés sur chaque carte : une courbe de croissance d’E. coli en LB et en M9 glucose sur un axe log₁₀ de la DO600, la viabilité de cellules HeLa sous cisplatine et doxorubicine sur un axe de concentration logarithmique, un test de tolérance au glucose chez des souris sauvages et db/db avec moyenne ± SEM calculée sur quatre souris par temps de mesure, et la pression artérielle systolique de trois bras d’essai de la semaine 0 à la semaine 24, espacée comme elle a été mesurée. Cliquez sur l’un d’eux pour charger son prompt et ses valeurs dans l’éditeur.

Courbe de croissance, axe y log
Dose-réponse, axe x log
Moyenne ± SEM des réplicats
Trois bras, visites irrégulières

Qu’est-ce qu’un graphique linéaire ?

Un graphique linéaire représente une valeur mesurée en fonction d’une variable x ordonnée, le plus souvent le temps ou la dose, et relie les points successifs par des segments pour montrer comment la valeur évolue. Chaque courbe correspond à une condition ou à un groupe. Comme l’axe des x est une droite graduée, ou une suite ordonnée de visites, l’écart entre deux points a un sens, et la pente entre deux points est le taux de variation sur cet intervalle. Dans les figures d’articles, les points sont en général des moyennes, chacune avec sa barre d’erreur.

À propos de cet outil

  • Saisissez une seule fois les valeurs de x (Temps (h) : 0, 2, 4, 8) puis une ligne par condition, ou joignez un tableau CSV, TSV ou Excel avec x dans la première colonne et une colonne par courbe, jusqu’à 6 courbes et 40 valeurs de x.
  • Les colonnes qui portent le même en-tête sont lues comme des réplicats et moyennées par le code. Les barres d’erreur représentent l’écart-type par défaut, la SEM ou un IC à 95 % si vous le précisez, et une colonne intitulée par exemple « KO SD » fournit les valeurs ± de cette courbe.
  • Des temps de prélèvement irréguliers gardent leur espacement réel sur l’axe des x. Demandez un axe x logarithmique pour des concentrations ou un axe y logarithmique pour des comptages et des DO, et les graduations tombent sur les puissances de dix.
  • Chaque courbe reçoit sa propre forme de marqueur, la légende liste les courbes dans l’ordre où elles se terminent à droite et se place dans un coin du graphique que les données laissent libre.
  • Chaque régénération reconstruit les points à partir de vos données ; changer de préréglage de revue ou de palette modifie l’aspect des courbes sans déplacer un seul point.

Les graphiques linéaires que vous pouvez créer

Les six graphiques linéaires qui reviennent le plus souvent au labo et en cours, ce qui distingue chacun d’eux et ce qu’il faut écrire pour l’obtenir.

Graphique linéaire en fonction du temps (série temporelle)

Une mesure suivie dans le temps, une courbe par condition. C’est la figure des comptages cellulaires sur plusieurs jours, du poids corporel sur des semaines ou d’un signal le long d’un enregistrement. Donnez les temps sous forme de nombres (Jour : 0, 3, 7, 14, 28) et les écarts restent proportionnels, si bien qu’un échantillonnage irrégulier ne passe pas pour régulier. L’unité va dans le titre de l’axe des x : Temps (h), Jours après traitement.

Graphique linéaire avec barres d’erreur

Chaque point est une moyenne, et sa barre indique la dispersion ou l’incertitude autour d’elle. Saisissez les réplicats de chaque temps sous la forme 1.0/1.2/0.9, ou joignez des colonnes de réplicats portant le même en-tête, et les moyennes sont calculées par le code. L’écart-type décrit la dispersion des réplicats ; la SEM et l’intervalle de confiance à 95 % disent avec quelle précision la moyenne elle-même est connue. Choisissez celui qu’il vous faut et indiquez-le dans la légende, avec n.

Graphique à deux courbes ou à plusieurs courbes

De deux à six courbes sur un même repère, comparées sur les mêmes valeurs de x. Avec deux courbes, le traité se lit à côté du témoin ; davantage de courbes conviennent à des groupes de doses ou à des génotypes. Ne gardez que les courbes que le lecteur doit comparer : au-delà de quatre ou cinq, couleurs et marqueurs se confondent, et des panneaux superposés partageant l’axe des x se lisent mieux.

Courbe de croissance bactérienne en échelle logarithmique

La densité cellulaire ou le nombre de cellules viables en fonction du temps sur un axe y logarithmique, où la croissance exponentielle devient une droite. Sur ce graphique semi-logarithmique, les phases de latence, exponentielle, stationnaire et de déclin se distinguent nettement, et la pente de la partie rectiligne donne le taux de croissance spécifique. Demandez une « échelle logarithmique sur l’axe y » et donnez des valeurs de DO600 ou d’UFC/mL supérieures à zéro.

Courbe dose-réponse

La réponse en fonction de la concentration sur un axe x logarithmique, de l’absence d’effet à l’effet maximal. Les concentrations augmentent en général d’un facteur dix ou trois à chaque palier, ce qu’un axe log espace régulièrement. Écrivez « axe x logarithmique » ; un témoin véhicule à la dose 0 n’a pas de place sur un axe log et il est retiré avec une mention. Les points mesurés sont reliés tels quels : aucune sigmoïde n’est ajustée et aucune CE50 n’est tracée si vous ne la fournissez pas.

Mesures répétées de l’inclusion au suivi

Les moyennes de groupe aux visites prévues, souvent exprimées en variation par rapport à l’inclusion. Les études cliniques et d’intervention rapportent Inclusion, Semaine 4, Semaine 12, Semaine 24. Donnez les semaines en nombres pour conserver l’espacement réel, ou en libellés pour espacer les visites régulièrement. Des courbes qui partent de 0 et passent en dessous montrent directement la variation, et l’axe y descend sous zéro pour les accueillir.

Comment faire un graphique linéaire ?

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Saisir x et les courbes

Saisissez une fois les valeurs de x, Temps (min) : 0, 15, 30, 60, puis une ligne par groupe, WT : 98, 208, 178, 142, ou joignez l’export du lecteur de plaques ou du tableur en CSV ou Excel.

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Préciser les barres et les axes

Nommez la barre d’erreur (écart-type, SEM ou IC à 95 %), demandez un axe logarithmique quand les valeurs couvrent plusieurs ordres de grandeur, et donnez chaque titre d’axe avec son unité entre guillemets.

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Choisir un style de revue et générer

Choisissez le préréglage Nature, Science ou Cell Press, les niveaux de gris cliniques ou une diapositive sombre pour un exposé. Les points, les graduations et l’ordre de la légende sont fixés par vos données ; un préréglage ne change que l’épaisseur des traits, les marqueurs et la couleur.

Choisir les axes et les barres d’erreur selon vos données

La plupart des erreurs dans un graphique linéaire sont des choix d’axes : des graduations régulières pour des temps irréguliers, un axe linéaire pour des valeurs qui sont multipliées par mille, un second axe y. Faites correspondre vos données au bon réglage.

Vos donnéesAxe des xAxe des yBarres d’erreur
Prélèvements à 0, 1, 2, 4, 8 et 24 hTemps linéaire, espacement réelLinéaireÉcart-type ou SEM de répétitions indépendantes
DO600 ou UFC/mL pendant la croissanceTemps linéaireLog₁₀ (graphique semi-logarithmique)Écart-type des réplicats biologiques
Réponse de 0.1 à 10 000 nMConcentration en log₁₀Linéaire, % du témoinSEM ou IC à 95 %
Visites à l’inclusion puis aux semaines 4, 12, 24Semaines en nombres, ou visites en libellés régulièrement espacésVariation par rapport à l’inclusion, passant par 0IC à 95 %
Deux variables d’unités différentesUn seul axe du temps partagéDeux panneaux superposés, un axe y chacunSelon chaque variable
Une expérience représentativeComme ci-dessusComme ci-dessusAucune, puisque n = 1

Les barres d’erreur portent sur des répétitions indépendantes, pas sur des réplicats techniques. Une seule expérience représentative a n = 1 et ne porte pas de barres d’erreur, et des puits répliqués d’une même expérience montrent la précision du pipetage plutôt que la variabilité biologique (Cumming, Fidler et Vaux, 2007).

Pente, taux de croissance et temps de génération à partir d’un graphique linéaire

La pente entre deux points d’un graphique linéaire est le taux de variation moyen sur cet intervalle ; sur une courbe de croissance semi-logarithmique, la pente de la partie rectiligne est le taux de croissance spécifique, qui fixe le temps de génération.

taux = (y₂ − y₁) / (x₂ − x₁) μ = (ln N₂ − ln N₁) / (t₂ − t₁) t_d = ln 2 / μ

En mots

Le taux, c’est la variation de y divisée par celle de x ; le taux de croissance, c’est l’augmentation de ln N par heure ; le temps de génération vaut 0.693 divisé par ce taux.

D’après l’exemple de courbe de croissance ci-dessus : en LB, la DO600 passe de 0.12 à 3 h à 0.5 à 5 h, donc μ = (ln 0.5 − ln 0.12) / 2 h = 0.71 par heure et t_d = 0.693 / 0.71 ≈ 0.97 h. L’outil trace les points mais ne calcule pas de pente et n’ajuste pas de courbe ; indiquez donc dans la légende tout taux que vous rapportez.

Vos questions sur le graphique linéaire

Comment faire un graphique linéaire à partir de mes données ?

Saisissez une fois les valeurs de x, puis une ligne par groupe, ou joignez le tableur. Par exemple : Temps (h) : 0, 2, 4, 8. Témoin : 0.05, 0.12, 0.31, 0.9. Traité : 0.05, 0.09, 0.18, 0.4. Ajoutez « moyenne ± SEM » avec les réplicats écrits 0.05/0.06/0.05 pour chaque point afin d’obtenir des barres d’erreur, « axe y logarithmique » pour des données de croissance, et les titres d’axes entre guillemets. Les points et les graduations sont calculés à partir de ces nombres avant que quoi que ce soit soit dessiné.

Graphique linéaire ou nuage de points : lequel choisir ?

Un graphique linéaire quand x est ordonné et que chaque point fait suite au précédent, comme pour un temps, une dose ou une visite ; un nuage de points quand chaque couple x–y est une observation indépendante. Relier des points revient à affirmer une évolution continue entre eux, ce qui vaut pour une cinétique mais pas, par exemple, pour la taille en fonction du poids chez différentes personnes. Pour des mesures appariées avec une droite de régression ou une corrélation, utilisez le générateur de nuage de points.

Faut-il mettre l’écart-type ou la SEM sur un graphique linéaire ?

L’écart-type pour décrire la variabilité des mesures, la SEM ou un intervalle de confiance à 95 % pour comparer des moyennes. Dans tous les cas, la légende doit nommer la mesure choisie et donner n, le nombre d’expériences indépendantes ou d’animaux derrière chaque point (Cumming, Fidler et Vaux, J Cell Biol 2007). Avec n = 3, représenter les valeurs individuelles est souvent plus parlant que n’importe quelle barre d’erreur.

Quand passer l’axe y d’un graphique linéaire en échelle logarithmique ?

Quand les valeurs couvrent plus d’un ordre de grandeur environ et varient de façon multiplicative, comme la croissance bactérienne, les titres viraux ou les dilutions en série. Sur un axe log, des rapports égaux occupent des distances égales, et une croissance exponentielle régulière se dessine donc comme une droite. Toutes les valeurs doivent être supérieures à zéro : un comptage de 0 ne peut pas être placé, l’outil garde alors un axe linéaire et explique pourquoi.

Un graphique linéaire peut-il avoir deux axes y ?

Pas ici, et beaucoup de revues le déconseillent : sur un graphique à double axe, l’endroit où deux courbes se croisent ne dépend que de la façon dont on a choisi l’étendue de chaque axe. Si vous demandez deux axes y ou des panneaux séparés, l’outil dessine des panneaux superposés partageant un même axe des x, chacun avec son axe y et ses graduations.

Pourquoi mes temps de mesure ne sont-ils pas régulièrement espacés sur l’axe des x ?

Parce qu’ils ne l’étaient pas dans le temps. Des prélèvements à 0, 1, 2, 4, 8 et 24 h sont placés à leur position réelle, si bien que la pente entre deux points est un vrai taux. Si les valeurs de x sont des noms de visites plutôt que des temps, saisissez-les comme libellés (Inclusion, Semaine 4, Semaine 12) et elles sont espacées régulièrement dans l’ordre donné.

Faut-il relier les points par des segments ou par une courbe lissée ?

Par des segments, sauf si vous avez un modèle. Un segment n’affirme rien sur ce qui s’est passé entre deux mesures ; une courbe lissée suggère des valeurs que personne n’a mesurées, et une sigmoïde ajustée suppose des paramètres ajustés. Si vous demandez une courbe lissée, elle passe exactement par chaque point sans dépassement ; pour une courbe dose-réponse ajustée, faites l’ajustement dans votre logiciel de statistiques et fournissez les valeurs de la courbe.

Que doit contenir la légende d’un graphique linéaire ?

Ce que sont les points, ce que représentent les barres d’erreur, le n derrière chaque point et ce que relient les courbes. Par exemple : « Glycémie après une charge orale en glucose chez des souris sauvages et db/db. Les points sont des moyennes ± SEM, n = 4 souris par groupe ; les segments relient les temps de mesure successifs. » Ajoutez le test statistique si la figure indique des différences significatives.

Combien de courbes un graphique linéaire peut-il contenir ?

Jusqu’à six courbes de 40 points au plus ici, mais quatre ou cinq constituent la limite pratique pour un lecteur. Chaque courbe reçoit sa couleur et sa forme de marqueur (cercle, carré, triangle, losange, triangle inversé, hexagone) et, dans les préréglages en niveaux de gris, son propre type de tirets. Au-delà, répartissez les conditions sur plusieurs panneaux.

Graphique en courbes et graphique linéaire, est-ce la même chose ?

Oui : « graphique en courbes » est le nom employé dans les tableurs comme Excel, « graphique linéaire » ou simplement « courbe » celui qu’on rencontre en cours et en sciences. Tous deux représentent des valeurs en fonction d’un axe des x ordonné et les relient par des segments. Un run-sequence plot est un graphique linéaire de mesures dans l’ordre où elles ont été prises, qui sert à repérer décalages et dérives (NIST/SEMATECH e-Handbook).

L’IA modifie-t-elle mes valeurs ?

Non : chaque point parvient au modèle d’image sous forme de coordonnée exacte. Les moyennes des réplicats, les bornes de l’écart-type, de la SEM ou de l’IC à 95 %, les étendues des deux axes, les libellés des graduations et l’ordre de la légende sont calculés par le code à partir de vos données à chaque génération, et le modèle a pour consigne de placer chaque point à sa valeur indiquée, sans moyenner, lisser ni réordonner quoi que ce soit.

Sources

Faites un graphique linéaire à partir de vos données

Saisissez les temps et les valeurs ou joignez le tableur, et obtenez un graphique linéaire au style revue dont chaque point et chaque barre d’erreur sont calculés par le code.

Créer un graphique linéaire